More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3891 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  43.54 
 
 
218 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 
218 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  43.9 
 
 
218 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  43.69 
 
 
218 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  41.51 
 
 
216 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  46.67 
 
 
194 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 
425 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 
363 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  37.09 
 
 
193 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  37.91 
 
 
327 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  37.91 
 
 
327 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  36.1 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  41.18 
 
 
207 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 
193 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  37.86 
 
 
207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  37.91 
 
 
340 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  36.61 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 
221 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  35.52 
 
 
221 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  35.52 
 
 
221 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  34.9 
 
 
208 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 
228 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 
356 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  34.53 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  34.17 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  34.16 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  34.16 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  34.16 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  34.16 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  33.54 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  33.54 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  33.54 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  33.54 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  42.16 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  32.11 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  24.19 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  32.34 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  32.74 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  23.56 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  29.63 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.26 
 
 
626 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  31.74 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.29 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.62 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  33.06 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  41.07 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  36.81 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  33.99 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  30.83 
 
 
271 aa  62.4  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  27.85 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  39.56 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  39.56 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  39.56 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  31.62 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.31 
 
 
444 aa  61.6  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 
208 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  25.34 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  31.33 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.59 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 
283 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  36.28 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  35.11 
 
 
310 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  22.96 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
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