More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3854 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  80.1 
 
 		 393 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  79.64 
 
 		 394 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  100 
 
 		 395 aa  799    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  79.9 
 
 		 394 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  78.83 
 
 		 393 aa  621  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  71.65 
 
 		 393 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  68.1 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  64.63 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  60.56 
 
 		 395 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  61.07 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  59.29 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  60.76 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  59.54 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  59.54 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  57.25 
 
 		 394 aa  454  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  58.78 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  56.63 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  55.61 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  55.61 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  58.72 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  55.87 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  56.89 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  59.44 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  60.05 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  57.14 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  56.63 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  58.16 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  61.01 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  56.38 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  56.38 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  56.38 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  56.38 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  56.38 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  56.38 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  57.8 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  56.6 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  56.35 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  56.6 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  60.96 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  60.96 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  58.73 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  56.35 
 
 		 397 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  55.61 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  55.1 
 
 		 394 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  56.35 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  60.51 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  58.48 
 
 		 395 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  56.6 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  60.71 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  56.35 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  55.75 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  57.91 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  58.23 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  54.31 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  55.24 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  53.08 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  54.73 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  53.45 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  53.71 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  55.5 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  54.22 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  54.85 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  55.24 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.14 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.74 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.49 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.62 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 		 390 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 394 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 		 392 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 		 393 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 390 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 		 392 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  45.94 
 
 		 408 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  47.18 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 		 393 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 390 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  45.2 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  45.83 
 
 		 393 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 395 aa  334  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  45.92 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>