More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3829 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  57.51 
 
 		 198 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  54.23 
 
 		 204 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  50.5 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  51.24 
 
 		 209 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  51.89 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  49.48 
 
 		 203 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  51.38 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  51.37 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  46.5 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  53.11 
 
 		 197 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  46.39 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  50.8 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  50.8 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  50.8 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  50.8 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  50.8 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  51.38 
 
 		 181 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  51.38 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  51.38 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  52.6 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  49.73 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  48.48 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  47.21 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  49.28 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  49.28 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  50.82 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  52.17 
 
 		 191 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  48.15 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  50.29 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  49.14 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  49.71 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  47.24 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  48.31 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  50.27 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  48.82 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  50.29 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  46.46 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  44.57 
 
 		 188 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  43.82 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  41.71 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  40.7 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  41.52 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  44.72 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  41.72 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  43.9 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  43.9 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  43.9 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  41.1 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  44.76 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  37.22 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  43.54 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  38.38 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  33.66 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  40.24 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  33.66 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  40.52 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  42.66 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  39.63 
 
 		 232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  39.63 
 
 		 232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  39.63 
 
 		 232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  39.63 
 
 		 232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  39.63 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  39.63 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  38.93 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  36.13 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  35.15 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  36.79 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  42.75 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.33 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  37.25 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  42.52 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  35.22 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
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NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  40.15 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  40.15 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
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NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
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NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
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