More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3770 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  61.03 
 
 		 287 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  50.51 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  46.67 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  51.57 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  50.87 
 
 		 318 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  50.52 
 
 		 318 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  47.94 
 
 		 312 aa  265  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  41.33 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  31.52 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  30.64 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  30.91 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  31.88 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  32.94 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  31.2 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  31.35 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.81 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  32.41 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.8 
 
 		 438 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.87 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  31.51 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  34.07 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  32.91 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  31.65 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.31 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  31.65 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.24 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  28.64 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  30.36 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  31.66 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  29.92 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.63 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  30.98 
 
 		 644 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 364 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.45 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  32.02 
 
 		 637 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  27.94 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  30.99 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 272 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>