More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3713 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6991  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  54.2 
 
 
1064 aa  1132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699098  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4473  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.01 
 
 
1052 aa  1167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0284  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.88 
 
 
1052 aa  1235  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2938  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.83 
 
 
1041 aa  1230  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  0.0317577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.94 
 
 
1050 aa  1135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3817  multidrug resistance protein MdtF  52.33 
 
 
1037 aa  1049  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0885908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  53.11 
 
 
1037 aa  1107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1835  multidrug efflux transport protein EefB  51.46 
 
 
1035 aa  1019  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99016e-07 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  56.05 
 
 
1049 aa  1153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.05 
 
 
1049 aa  1153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  53.01 
 
 
1037 aa  1106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.67 
 
 
1034 aa  1136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0203  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  52.33 
 
 
1037 aa  1053  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.115131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3718  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  50.68 
 
 
1041 aa  1016  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.45 
 
 
1050 aa  1142  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  54.95 
 
 
1043 aa  1112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.84 
 
 
1049 aa  1153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0132  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  52.87 
 
 
1045 aa  1099  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1599  multidrug efflux protein  54.19 
 
 
1046 aa  1060  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.533653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1721  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.07 
 
 
1059 aa  1023  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.71 
 
 
1055 aa  863  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3912  multidrug resistance protein MdtF  52.23 
 
 
1037 aa  1048  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  56.05 
 
 
1049 aa  1153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0890  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.83 
 
 
1034 aa  1059  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0191734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3491  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.48 
 
 
1052 aa  1108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.67 
 
 
1064 aa  1157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.52 
 
 
1055 aa  979  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.97 
 
 
1066 aa  1143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1544  multidrug efflux protein  54.68 
 
 
1045 aa  1070  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  100 
 
 
1058 aa  2114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3632  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.42 
 
 
1047 aa  1147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.840793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0931  multidrug-efflux transporter  49.61 
 
 
1055 aa  988  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6681  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.61 
 
 
1063 aa  1093  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0860395  normal  0.0938677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6464  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.31 
 
 
1062 aa  1115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4502  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.18 
 
 
1053 aa  1186  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.39279  hitchhiker  0.00639664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.06 
 
 
1066 aa  1142  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.59 
 
 
1047 aa  1140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.03 
 
 
1050 aa  1132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2481  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.64 
 
 
1042 aa  1222  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107947  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0153  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.52 
 
 
1050 aa  1122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4000  multidrug resistance protein MdtF  52.33 
 
 
1037 aa  1051  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  55.67 
 
 
1034 aa  1135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  52.82 
 
 
1037 aa  1103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  56.05 
 
 
1049 aa  1153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3716  multidrug resistance protein MdtF  52.33 
 
 
1037 aa  1053  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  55.77 
 
 
1034 aa  1139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  52.91 
 
 
1037 aa  1102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  56.05 
 
 
1049 aa  1153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01756  hypothetical protein  52.82 
 
 
1053 aa  1066  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0531  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.34 
 
 
1044 aa  1118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3585  RND efflux transporter  50.68 
 
 
1041 aa  1017  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3068  acriflavine resistance protein B  56.45 
 
 
1050 aa  1142  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.24086e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1268  aminoglycoside/multidrug efflux system  54.95 
 
 
1043 aa  1112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.44 
 
 
1054 aa  1075  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.89 
 
 
1049 aa  899  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1126  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.03 
 
 
1048 aa  1140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.46715e-06  unclonable  4.81916e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2478  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  52.03 
 
 
1051 aa  965  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3700  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  55.65 
 
 
1033 aa  1101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.35 
 
 
1043 aa  1193  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3326  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.01 
 
 
1054 aa  1176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.775486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4007  RND efflux transporter  50.58 
 
 
1041 aa  1014  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  56.35 
 
 
1050 aa  1141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  54.85 
 
 
1085 aa  1111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.51 
 
 
1047 aa  1140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434196  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1615  multidrug efflux protein  54.78 
 
 
1045 aa  1090  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0631699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.45 
 
 
1066 aa  1145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5857  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.35 
 
 
1049 aa  1152  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.57 
 
 
1046 aa  1168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3368  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.71 
 
 
1065 aa  995  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  70.72 
 
 
1051 aa  1494  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4384  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.82 
 
 
1044 aa  1134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2895  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.76 
 
 
1059 aa  1016  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4060  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.81 
 
 
1052 aa  1129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00709591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2807  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.19 
 
 
1041 aa  989  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0699119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4250  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.82 
 
 
1044 aa  1135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1885  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  50.72 
 
 
1041 aa  1022  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.88318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.08 
 
 
1050 aa  1211  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4832  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  72.47 
 
 
1054 aa  1529  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51560  multidrug efflux pump RND-family transporter protein  54.37 
 
 
1046 aa  1110  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.793904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01890  Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.58 
 
 
1046 aa  1125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2326  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.42 
 
 
1055 aa  981  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0317  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  70.52 
 
 
1048 aa  1458  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173741  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6028  acriflavin resistance protein B  49.62 
 
 
1044 aa  993  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5152  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  59.22 
 
 
1055 aa  1228  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3016  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.76 
 
 
1056 aa  1240  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0546  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  56.22 
 
 
1056 aa  1082  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2163  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.77 
 
 
1078 aa  885  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5496  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.25 
 
 
1053 aa  1250  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.7814  normal  0.546189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3650  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  59.01 
 
 
1056 aa  1175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1454  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  52.7 
 
 
1049 aa  1005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4211  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  54.82 
 
 
1044 aa  1134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0505  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  55.65 
 
 
1051 aa  1164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3446  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  50.49 
 
 
1036 aa  972  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.522108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0911  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  56.66 
 
 
1051 aa  1074  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  69.51 
 
 
1050 aa  1432  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.35 
 
 
1042 aa  870  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.32541e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003894  acridine efflux pump  52.63 
 
 
1053 aa  1051  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4116  aminoglycoside/multidrug efflux system  53.69 
 
 
1036 aa  1091  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3242  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  56.34 
 
 
1042 aa  1141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0102  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.22 
 
 
1051 aa  1093  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>