More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3645 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  100 
 
 		 429 aa  855    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  65.41 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  64.72 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.71 
 
 		 402 aa  272  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.05 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.7 
 
 		 407 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.59 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  37.93 
 
 		 402 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.04 
 
 		 412 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.47 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.3 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.65 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.07 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.72 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.78 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.56 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.6 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.99 
 
 		 410 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.69 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.04 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  35.15 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.47 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  35.8 
 
 		 404 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  36.05 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  33.84 
 
 		 405 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.86 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.27 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.62 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.19 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.33 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.5 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  34.3 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.45 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  34.95 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  28.51 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.06 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  29.3 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.45 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.45 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.07 
 
 		 411 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.59 
 
 		 407 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  28.84 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.07 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.78 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  34.15 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.34 
 
 		 411 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.58 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  33.5 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.34 
 
 		 411 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.34 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.38 
 
 		 411 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.3 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.16 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.06 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.28 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.29 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.19 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  34.62 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.34 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.73 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.33 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  30.1 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  30.1 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  33.75 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34.77 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  28.6 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.1 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  35.9 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  33.33 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  35.95 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  32.99 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  32.99 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  32.99 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.67 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  33.42 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  32.26 
 
 		 938 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  35.99 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.98 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  35.29 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.82 
 
 		 417 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.73 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  34.64 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  34.13 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.95 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  33.58 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.89 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.06 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  32.78 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  35.21 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  31.41 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  34.8 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.07 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  37.08 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  37.08 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  37.08 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.01 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.79 
 
 		 412 aa  189  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  33.5 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.32 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.7 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>