151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3619 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  100 
 
 
310 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  74.12 
 
 
289 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  78.1 
 
 
296 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  78.1 
 
 
296 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  76.26 
 
 
315 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  69.33 
 
 
286 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2234  metallophosphoesterase  61.96 
 
 
316 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  63.53 
 
 
316 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  64.03 
 
 
314 aa  341  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  62.4 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  59.35 
 
 
309 aa  334  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  55.67 
 
 
309 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  63.33 
 
 
276 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  60.91 
 
 
268 aa  332  7.000000000000001e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  55.26 
 
 
325 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  58.58 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  63.39 
 
 
301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  58.58 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  53.7 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  58.87 
 
 
312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  58.87 
 
 
312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  58.87 
 
 
312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.23 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  52.23 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  54.42 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.23 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.23 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.23 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.23 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.23 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  59.77 
 
 
355 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  64.08 
 
 
290 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  59.22 
 
 
270 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  52.53 
 
 
315 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  61.98 
 
 
265 aa  322  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  59.22 
 
 
270 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  59.22 
 
 
270 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  59.84 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  61.32 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  61.32 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  60.66 
 
 
266 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  61.16 
 
 
269 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  60.82 
 
 
265 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  59.5 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  60.17 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  59.45 
 
 
265 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  59.06 
 
 
270 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0018  metallophosphoesterase  57.65 
 
 
283 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.511643  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  57.14 
 
 
270 aa  309  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  62.03 
 
 
280 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1735  metallophosphoesterase  57.98 
 
 
303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0014324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  58.54 
 
 
322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  59.68 
 
 
280 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  62.03 
 
 
280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  59.92 
 
 
272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  56.97 
 
 
290 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  53.28 
 
 
288 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  54.41 
 
 
277 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  57.74 
 
 
286 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  54.51 
 
 
273 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  57.5 
 
 
270 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  55.79 
 
 
268 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  54.84 
 
 
273 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  54.44 
 
 
273 aa  288  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  57.37 
 
 
275 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  55.26 
 
 
275 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  56.25 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  59.5 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  52.08 
 
 
279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  54.1 
 
 
274 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  52.59 
 
 
273 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  55.38 
 
 
273 aa  278  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  55.38 
 
 
273 aa  278  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  54.47 
 
 
265 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  54.07 
 
 
265 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  53.94 
 
 
271 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  48.33 
 
 
289 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  54.36 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  53.94 
 
 
270 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000165478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  51.35 
 
 
283 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  55.42 
 
 
284 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  50.82 
 
 
255 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  50.21 
 
 
286 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  52.65 
 
 
275 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  45.21 
 
 
272 aa  248  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  46.06 
 
 
267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  48.35 
 
 
300 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  46.5 
 
 
265 aa  239  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3207  metallophosphoesterase  41.64 
 
 
374 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.603863  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3813  calcineurin-like phosphoesterase  42.23 
 
 
298 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3207  metallophosphoesterase  39.8 
 
 
374 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.949256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3346  metallophosphoesterase  39.8 
 
 
374 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
360 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3025  metallophosphoesterase  44.86 
 
 
293 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  42.69 
 
 
352 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
360 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
357 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2538  metallophosphoesterase  47.56 
 
 
269 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1160  metallophosphoesterase  42.97 
 
 
352 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>