More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3607 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
413 aa  832    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  62.01 
 
 
390 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  62.01 
 
 
390 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  55.56 
 
 
408 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  55.47 
 
 
396 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  53.83 
 
 
396 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  52.53 
 
 
406 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  54.38 
 
 
400 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.43 
 
 
396 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  52.76 
 
 
406 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  53.48 
 
 
406 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  53.91 
 
 
416 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  51.02 
 
 
403 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.18 
 
 
403 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  53.24 
 
 
404 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  51.99 
 
 
403 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  50.8 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  50.93 
 
 
373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  50.13 
 
 
406 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  49.07 
 
 
432 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  48.7 
 
 
405 aa  346  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  47.57 
 
 
378 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  49.48 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  45.26 
 
 
655 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  44.19 
 
 
385 aa  298  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  41.04 
 
 
441 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.46 
 
 
373 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  43.34 
 
 
378 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  44.15 
 
 
393 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  43.01 
 
 
377 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
381 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.03 
 
 
377 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
416 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
377 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
377 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
377 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
381 aa  209  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
378 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
381 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
376 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
378 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.2 
 
 
377 aa  206  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
377 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.09 
 
 
377 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.35 
 
 
377 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
420 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  35.88 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.41 
 
 
373 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.34 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
353 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  30.99 
 
 
382 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.4 
 
 
380 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  33.07 
 
 
385 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
390 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.4 
 
 
380 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
375 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
345 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
380 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  29.55 
 
 
380 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  31.94 
 
 
382 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
375 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.03 
 
 
381 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
385 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
381 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  30.1 
 
 
382 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  30.1 
 
 
382 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 
367 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
387 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
394 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.15 
 
 
381 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  30.16 
 
 
376 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  35.98 
 
 
378 aa  186  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
427 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
363 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  36.47 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 
357 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
387 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  34.69 
 
 
355 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
333 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
393 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
387 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
385 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 
374 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
434 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
382 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  31.77 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  33.24 
 
 
350 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>