More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3568 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.7 
 
 		 681 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  76.04 
 
 		 684 aa  998    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 683 aa  706    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 682 aa  1377    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.41 
 
 		 681 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.58 
 
 		 690 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.41 
 
 		 681 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.96 
 
 		 678 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  75.92 
 
 		 684 aa  1000    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  75.74 
 
 		 684 aa  998    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 679 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  76.33 
 
 		 683 aa  1003    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.79 
 
 		 679 aa  799    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 		 686 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 		 678 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  68.54 
 
 		 684 aa  936    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 675 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.9 
 
 		 678 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.09 
 
 		 691 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 		 687 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 		 695 aa  722    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.57 
 
 		 676 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  84.43 
 
 		 686 aa  1107    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.22 
 
 		 675 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.71 
 
 		 686 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.78 
 
 		 690 aa  737    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.96 
 
 		 686 aa  768    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.83 
 
 		 683 aa  722    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.83 
 
 		 681 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.41 
 
 		 681 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.9 
 
 		 678 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 674 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.24 
 
 		 685 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.32 
 
 		 686 aa  611  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.44 
 
 		 664 aa  605  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  48.75 
 
 		 836 aa  597  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.85 
 
 		 683 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.56 
 
 		 703 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 702 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.78 
 
 		 706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.89 
 
 		 688 aa  552  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 		 531 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 531 aa  357  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 531 aa  352  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 518 aa  350  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  43.73 
 
 		 517 aa  346  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  44.29 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 519 aa  343  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 		 523 aa  334  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.41 
 
 		 520 aa  328  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  41.8 
 
 		 515 aa  134  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  29.46 
 
 		 476 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  29.14 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  29.14 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  29.14 
 
 		 476 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  33 
 
 		 487 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  26.26 
 
 		 496 aa  117  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  27.75 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  46 
 
 		 148 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4763  Aldehyde Dehydrogenase  25.92 
 
 		 500 aa  114  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  28 
 
 		 474 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  25.29 
 
 		 496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  31 
 
 		 488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  25.29 
 
 		 496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  24.81 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  26.61 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  28.77 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  32.67 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  32.31 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.6 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  30.36 
 
 		 487 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  25.11 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  24.85 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  27.02 
 
 		 495 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  45.58 
 
 		 148 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  26.92 
 
 		 491 aa  107  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  27.42 
 
 		 477 aa  107  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  27.17 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  25.97 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  25.97 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  31.97 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.76 
 
 		 481 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  26.97 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.46 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4298  aldehyde dehydrogenase  28.08 
 
 		 485 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  26.09 
 
 		 510 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 		 496 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  28.05 
 
 		 483 aa  104  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  25.41 
 
 		 475 aa  103  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  26.62 
 
 		 478 aa  103  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  28.31 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  29.34 
 
 		 798 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  30.08 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  27.96 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  26.89 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  25.73 
 
 		 480 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  27.13 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  27.13 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4410  Aldehyde Dehydrogenase  29.87 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>