More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3561 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  100 
 
 		 295 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  64.81 
 
 		 291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  56.74 
 
 		 290 aa  301  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  57.64 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  55.56 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  57.29 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  61.9 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  57.59 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  58.19 
 
 		 289 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  60.45 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  56.75 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  57.84 
 
 		 289 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  59.38 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  56.43 
 
 		 284 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  59.72 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  59.85 
 
 		 290 aa  281  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  59.17 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  56.29 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  58.82 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  54.9 
 
 		 289 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  55.56 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  56.51 
 
 		 284 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  55.24 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  62.21 
 
 		 290 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  60.07 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  60.07 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  55.71 
 
 		 289 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  60.69 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  52.22 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  56.6 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  58.74 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  53.92 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  52.46 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  58.39 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  51.29 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  52.6 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  59.33 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  48.07 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  53.19 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  50.7 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  47.45 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  51.05 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  28.42 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  28.42 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.9 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.03 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.78 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  34.01 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.3 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.27 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.01 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.01 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.35 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.35 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.35 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  25.77 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.19 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.74 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.29 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  31.19 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  31.54 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.93 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.46 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.55 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  30.27 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  29.32 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  26.3 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  30.18 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  28.03 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  36.2 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.27 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  27.27 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  28.04 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  26.3 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 280 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  32.44 
 
 		 303 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  27.84 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  33.92 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  28.24 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  31.76 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.58 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  27.97 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  32.44 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  32.52 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  30.17 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  32.16 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.08 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  26.79 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  27.11 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>