148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3491 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  56.67 
 
 
207 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  46.08 
 
 
223 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  46.48 
 
 
229 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  44.81 
 
 
230 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.37 
 
 
209 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.51 
 
 
214 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.86 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.74 
 
 
234 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  42.23 
 
 
220 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  41.83 
 
 
217 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.4 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  43.4 
 
 
215 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.4 
 
 
215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.33 
 
 
211 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.04 
 
 
211 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 
210 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  41.98 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  42.38 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.86 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.86 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  41.04 
 
 
211 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  41.9 
 
 
211 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.9 
 
 
211 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.9 
 
 
211 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  40.58 
 
 
200 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  36.98 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  38.02 
 
 
216 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  36.46 
 
 
217 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  39.69 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  34.02 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.02 
 
 
190 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.5 
 
 
191 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  38.76 
 
 
196 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  33.85 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  34.85 
 
 
196 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.86 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  34.55 
 
 
202 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  35.48 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33.85 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  34.87 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  35.14 
 
 
194 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  35.82 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  35.86 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.5 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.03 
 
 
196 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.38 
 
 
194 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  33.5 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  30.65 
 
 
198 aa  85.1  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.01 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.55 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.89 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  27.92 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.09 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  25.38 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.97 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.93 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.93 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  36.97 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.93 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  28.88 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.17 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.21 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  28 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  32.38 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.66 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  28 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  40.5 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  29.74 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.25 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  29.74 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.73 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  26.78 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  40.45 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  44.09 
 
 
265 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  42.27 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  31.37 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  39.58 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.1 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  34.29 
 
 
111 aa  58.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.35 
 
 
232 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  38.89 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.09 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  28.02 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  26.29 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  37.63 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.91 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  36.56 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  36.56 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  26.34 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.44 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>