More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3460 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  100 
 
 
530 aa  1068  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  55.72 
 
 
542 aa  584  1e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  56.13 
 
 
537 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  57.33 
 
 
515 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  53.76 
 
 
498 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  51.64 
 
 
500 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  53.62 
 
 
543 aa  515  1e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  51.37 
 
 
504 aa  515  1e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  53.62 
 
 
515 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.67 
 
 
504 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  53.23 
 
 
512 aa  508  1e-142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.52 
 
 
505 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  51.64 
 
 
516 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  50.19 
 
 
520 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.09 
 
 
527 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.81 
 
 
523 aa  494  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  55.64 
 
 
518 aa  494  1e-138  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  50.1 
 
 
516 aa  492  1e-138  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  49.34 
 
 
528 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.44 
 
 
526 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  49.34 
 
 
528 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  48.07 
 
 
507 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.49 
 
 
507 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  50.09 
 
 
505 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  50.09 
 
 
505 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.09 
 
 
505 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  50.09 
 
 
505 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  50.09 
 
 
505 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  49.91 
 
 
505 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  49.91 
 
 
505 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  49.72 
 
 
592 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  51.37 
 
 
501 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  45.81 
 
 
484 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.7 
 
 
497 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.95 
 
 
506 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  44.83 
 
 
484 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.49 
 
 
484 aa  401  1e-110  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.65 
 
 
493 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.15 
 
 
484 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.04 
 
 
479 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.53 
 
 
484 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.04 
 
 
507 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.91 
 
 
484 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.98 
 
 
492 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  45.32 
 
 
484 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.16 
 
 
571 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  45.38 
 
 
485 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.71 
 
 
507 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.52 
 
 
507 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.47 
 
 
467 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  43.11 
 
 
492 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  41.88 
 
 
496 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.91 
 
 
492 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.92 
 
 
485 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.59 
 
 
496 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.73 
 
 
485 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.66 
 
 
512 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  45.72 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  45.9 
 
 
484 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  46.4 
 
 
476 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.24 
 
 
486 aa  365  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.89 
 
 
504 aa  364  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  41.55 
 
 
490 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.46 
 
 
487 aa  359  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.29 
 
 
488 aa  357  3e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  44.05 
 
 
483 aa  356  6e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  40.31 
 
 
493 aa  356  6e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  38.92 
 
 
494 aa  352  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  42.32 
 
 
496 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.98 
 
 
488 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.59 
 
 
481 aa  343  3e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.57 
 
 
480 aa  342  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  38.56 
 
 
499 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  38.1 
 
 
480 aa  327  4e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.96 
 
 
484 aa  310  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.42 
 
 
468 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.56 
 
 
461 aa  296  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  42.31 
 
 
467 aa  296  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.28 
 
 
467 aa  292  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.09 
 
 
552 aa  275  1e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.11 
 
 
514 aa  260  5e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.7 
 
 
490 aa  245  1e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  29.49 
 
 
1363 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.57 
 
 
470 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.33 
 
 
450 aa  163  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.93 
 
 
276 aa  142  1e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  34.41 
 
 
288 aa  130  7e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  32.35 
 
 
280 aa  129  1e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  34.41 
 
 
288 aa  128  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.57 
 
 
305 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.33 
 
 
284 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  41.46 
 
 
1387 aa  119  1e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
1350 aa  118  2e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  31.54 
 
 
282 aa  118  2e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.89 
 
 
301 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.04 
 
 
284 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  37.29 
 
 
156 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3420  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  40.22 
 
 
950 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.6 
 
 
282 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.97 
 
 
287 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>