67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3304 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  100 
 
 		 358 aa  734    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  65.98 
 
 		 360 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  66.17 
 
 		 378 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  65.98 
 
 		 360 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  65.69 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  65.1 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  65.37 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  60.12 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  54.12 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  54.97 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  52.33 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.87 
 
 		 765 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  51.21 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  49.55 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.34 
 
 		 475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  35.97 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  26.8 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  29.76 
 
 		 311 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.51 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.54 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.16 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  25.2 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  25.2 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  25.2 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.21 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  28.03 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  28.03 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  25.58 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  24.79 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  36.99 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  21.96 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.58 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  22.71 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  22.86 
 
 		 314 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.71 
 
 		 361 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 372 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  25.73 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  24.73 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  23.93 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  23.17 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  23.01 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  26.82 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  33.77 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.88 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  25.53 
 
 		 372 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  35.82 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  22.67 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  28.85 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  25.87 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  22.31 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  27.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  23.53 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  24.11 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  31.71 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>