More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3259 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  63.68 
 
 		 376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  57.22 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.95 
 
 		 362 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.95 
 
 		 362 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  57.49 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.95 
 
 		 362 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.95 
 
 		 362 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.86 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.13 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.32 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.13 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.59 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.83 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.83 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.24 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.83 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.28 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.83 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.83 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.83 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.56 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.75 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  58.71 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.44 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  55.59 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.71 
 
 		 377 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  53.93 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  54.34 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  54.43 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.43 
 
 		 369 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.92 
 
 		 372 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  53.73 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.07 
 
 		 422 aa  338  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.79 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  53.51 
 
 		 382 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.86 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  57.37 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.63 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.56 
 
 		 378 aa  325  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.33 
 
 		 350 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.4 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.87 
 
 		 350 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.32 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.06 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.87 
 
 		 348 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.81 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.94 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.05 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.27 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.36 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.36 
 
 		 370 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  48.66 
 
 		 352 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.49 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.28 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.18 
 
 		 355 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.59 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.01 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.01 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.01 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.43 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  45.01 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.33 
 
 		 359 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  44.74 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.74 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.03 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.79 
 
 		 359 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  47.97 
 
 		 353 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.88 
 
 		 355 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.82 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.63 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.26 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.8 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.29 
 
 		 352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.28 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1782  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.34 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.54 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1500  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.14 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.914379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1893  FAD linked oxidase domain protein  40.11 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.19 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.62 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  37.2 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  40.37 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.84 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  38.3 
 
 		 396 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.21 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  37.53 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.3 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  35.16 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  38.22 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.91 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  34.41 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  35.16 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  34.81 
 
 		 412 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.39 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  34.23 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1019  putative glycolate oxidase subunit protein  36.13 
 
 		 358 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>