286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3226 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  56.81 
 
 
258 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  51.54 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  51.54 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  51.54 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  51.54 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  51.54 
 
 
427 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  51.15 
 
 
479 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  51.54 
 
 
444 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  51.54 
 
 
399 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  51.15 
 
 
493 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  51.75 
 
 
260 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  50.77 
 
 
444 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  50.77 
 
 
442 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  52.19 
 
 
251 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  50.77 
 
 
442 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  50.77 
 
 
444 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  50.77 
 
 
442 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  50.77 
 
 
444 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  50.77 
 
 
356 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  51.79 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  52.33 
 
 
258 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  51.18 
 
 
266 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  48.83 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  46.24 
 
 
313 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  47.17 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  45.45 
 
 
307 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  45.9 
 
 
295 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  46.69 
 
 
305 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  46.69 
 
 
305 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  36.84 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  34.65 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  44.72 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  39.59 
 
 
248 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  39.59 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  43.35 
 
 
231 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  37.2 
 
 
229 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  37.44 
 
 
250 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  37.8 
 
 
233 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  40 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  40 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  40 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  35.15 
 
 
231 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  41.42 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  33.95 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  34.85 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  40.7 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  33.18 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  46.29 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  37.02 
 
 
256 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  37.25 
 
 
272 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  36.64 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  44.38 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  35.94 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  34.22 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  38.29 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  37.57 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  42.01 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  33.8 
 
 
238 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  33.33 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  35.41 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  32.02 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  44.31 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  40.1 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  36.21 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  36.21 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  37.12 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  32.86 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  36.21 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  43.9 
 
 
235 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  36.51 
 
 
247 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  35.78 
 
 
268 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  41.21 
 
 
280 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  37.19 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  34.84 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  35.34 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  42.77 
 
 
298 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  41.27 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  35.81 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  36.68 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  36.45 
 
 
278 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  38.95 
 
 
240 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  36.45 
 
 
278 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  35.15 
 
 
238 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  39.05 
 
 
237 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  33.07 
 
 
256 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  34.98 
 
 
274 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  33.61 
 
 
264 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  33.59 
 
 
268 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1620  glutamine amidotransferase-like  38.58 
 
 
278 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000108554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  36.33 
 
 
267 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  33.47 
 
 
273 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  36.75 
 
 
231 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  42.41 
 
 
237 aa  105  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  37.19 
 
 
269 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  36.18 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  38.38 
 
 
264 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  38.5 
 
 
255 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  33.94 
 
 
259 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>