201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3217 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  49.68 
 
 		 795 aa  767    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  61.41 
 
 		 813 aa  1014    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  59.23 
 
 		 806 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  49.68 
 
 		 795 aa  767    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  60.85 
 
 		 803 aa  991    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  49.87 
 
 		 788 aa  731    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  59.53 
 
 		 806 aa  955    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  60.1 
 
 		 803 aa  984    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  50.13 
 
 		 788 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  48.58 
 
 		 784 aa  710    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  58.85 
 
 		 806 aa  947    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  50.97 
 
 		 791 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  100 
 
 		 821 aa  1683    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  60.22 
 
 		 803 aa  987    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  58.73 
 
 		 806 aa  939    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  58.85 
 
 		 806 aa  947    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  51.95 
 
 		 791 aa  756    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  50.19 
 
 		 788 aa  765    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  58.66 
 
 		 806 aa  939    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  51.42 
 
 		 787 aa  780    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  50.64 
 
 		 799 aa  790    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  51.1 
 
 		 791 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  52.37 
 
 		 790 aa  759    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  50.97 
 
 		 789 aa  763    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  32.77 
 
 		 779 aa  336  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.73 
 
 		 801 aa  316  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03504  alpha-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06560)  32.92 
 
 		 830 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 777 aa  307  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  29.73 
 
 		 779 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  33.08 
 
 		 803 aa  298  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  29.42 
 
 		 797 aa  297  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  31.19 
 
 		 828 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.76 
 
 		 776 aa  289  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.02 
 
 		 799 aa  288  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.8 
 
 		 779 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.82 
 
 		 785 aa  284  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.66 
 
 		 752 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  31.6 
 
 		 743 aa  266  8e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.67 
 
 		 768 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.59 
 
 		 794 aa  265  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01640  glicosidase, putative  30.15 
 
 		 892 aa  262  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  29.37 
 
 		 746 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.69 
 
 		 792 aa  262  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  30.19 
 
 		 821 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  31.99 
 
 		 760 aa  257  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  32.43 
 
 		 765 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  31.59 
 
 		 806 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.05 
 
 		 836 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  33.27 
 
 		 765 aa  238  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  29.64 
 
 		 825 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.63 
 
 		 845 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.88 
 
 		 798 aa  230  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.74 
 
 		 770 aa  230  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  31.7 
 
 		 828 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  30.23 
 
 		 815 aa  223  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  31.58 
 
 		 685 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  29.6 
 
 		 816 aa  220  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.81 
 
 		 762 aa  213  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  30.09 
 
 		 681 aa  212  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  26.72 
 
 		 702 aa  212  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  29.65 
 
 		 764 aa  209  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  29.34 
 
 		 779 aa  209  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  27.71 
 
 		 764 aa  208  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  30.9 
 
 		 683 aa  206  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  29.66 
 
 		 795 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  30.78 
 
 		 763 aa  206  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  28.3 
 
 		 771 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  30.49 
 
 		 749 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.83 
 
 		 687 aa  201  5e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  27.33 
 
 		 911 aa  200  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  25.04 
 
 		 728 aa  200  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 		 806 aa  200  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.39 
 
 		 775 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.65 
 
 		 839 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.9 
 
 		 700 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  29.02 
 
 		 760 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  28.52 
 
 		 712 aa  196  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  30.04 
 
 		 804 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  26.89 
 
 		 715 aa  194  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  28.85 
 
 		 760 aa  191  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  27.08 
 
 		 772 aa  190  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 		 778 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  28.24 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  28.24 
 
 		 772 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  28.24 
 
 		 772 aa  189  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  28.24 
 
 		 772 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  28.24 
 
 		 772 aa  189  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  28.24 
 
 		 772 aa  189  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  28.35 
 
 		 772 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  28.22 
 
 		 772 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  28.06 
 
 		 656 aa  187  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  28.49 
 
 		 772 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  27.4 
 
 		 780 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  29.64 
 
 		 766 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  28.18 
 
 		 772 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  27.97 
 
 		 661 aa  185  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  28.22 
 
 		 772 aa  184  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  28.3 
 
 		 772 aa  184  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  29.77 
 
 		 775 aa  183  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  27.9 
 
 		 772 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>