More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3170 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  66.84 
 
 		 186 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  64.17 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  61.62 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  61.62 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  63.64 
 
 		 186 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  64.17 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  64.17 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  64.17 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  64.17 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  63.64 
 
 		 186 aa  229  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  63.64 
 
 		 205 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  64.17 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  63.98 
 
 		 185 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  62.57 
 
 		 186 aa  227  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  62.57 
 
 		 186 aa  227  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  62.57 
 
 		 186 aa  227  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  59.89 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  59.89 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  62.5 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  62.5 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  59.46 
 
 		 184 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  64.84 
 
 		 189 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  63.19 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  64.13 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  55.79 
 
 		 188 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  60.33 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  61.41 
 
 		 188 aa  214  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  56.45 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  57.75 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  57.22 
 
 		 187 aa  191  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  59.66 
 
 		 183 aa  187  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.06 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  67.42 
 
 		 129 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  49.46 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  53.23 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  53.23 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  47.19 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  48.07 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.18 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.97 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  40.1 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  39.49 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  40.51 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  40.51 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.02 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.76 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.63 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  39.25 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  40.53 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  40.53 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  40.53 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  41.49 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.62 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  38.74 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.78 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  38.95 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.89 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.46 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  46.55 
 
 		 120 aa  106  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  40.41 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  38.14 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.5 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.01 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  38.95 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  38.95 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  40.91 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  40.98 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.91 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.04 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  43.87 
 
 		 305 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  39.68 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.57 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.18 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0986  resolvase-like protein  51.69 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  35.83 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  34.03 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  39.57 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  36.27 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  36.27 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  36.27 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>