97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3160 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4469  hypothetical protein  77.72 
 
 		 395 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2882  hypothetical protein  78.48 
 
 		 395 aa  662    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1659  hypothetical protein  76.96 
 
 		 395 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1091  hypothetical protein  78.63 
 
 		 393 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.613907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3559  hypothetical protein  78.23 
 
 		 395 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306765  normal  0.452046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0858  hypothetical protein  72.97 
 
 		 407 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3954  hypothetical protein  78.99 
 
 		 395 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1219  hypothetical protein  72.1 
 
 		 405 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1591  hypothetical protein  76.67 
 
 		 403 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.66492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2359  hypothetical protein  76.71 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.588957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0927  hypothetical protein  71.65 
 
 		 391 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.045473  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0996  hypothetical protein  71.65 
 
 		 391 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397652  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0862  hypothetical protein  70.89 
 
 		 391 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0358737  normal  0.649536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1021  hypothetical protein  70.63 
 
 		 391 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0984  hypothetical protein  70.13 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3316  hypothetical protein  70.38 
 
 		 391 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1330  hypothetical protein  69.87 
 
 		 798 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1230  VWA containing CoxE family protein  69.62 
 
 		 391 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.853007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5675  hypothetical protein  69.37 
 
 		 391 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2333  VWA containing CoxE family protein  69.62 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2372  hypothetical protein  69.37 
 
 		 391 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0944  VWA containing CoxE family protein  69.62 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1015  hypothetical protein  69.87 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0850  hypothetical protein  69.87 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207331  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1721  VWA containing CoxE-like  69.62 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0167307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1169  hypothetical protein  69.87 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2356  VWA containing CoxE family protein  69.62 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1937  hypothetical protein  69.87 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0236151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2252  hypothetical protein  69.11 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2102  hypothetical protein  68.61 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1177  hypothetical protein  69.87 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0298  hypothetical protein  69.87 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0964  hypothetical protein  68.86 
 
 		 391 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0815038  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0905  hypothetical protein  63.57 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.687363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1383  VWA containing CoxE family protein  61.17 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1315  hypothetical protein  57.58 
 
 		 392 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3874  hypothetical protein  57.83 
 
 		 392 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0400507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3982  hypothetical protein  56.31 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4574  hypothetical protein  57.58 
 
 		 392 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0368264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1604  hypothetical protein  57.07 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4095  hypothetical protein  57.83 
 
 		 392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0303832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1408  hypothetical protein  57.07 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29160  hypothetical protein  56.06 
 
 		 393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0682429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32870  hypothetical protein  57.07 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2515  hypothetical protein  55.95 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.762903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1579  hypothetical protein  56.57 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1787  hypothetical protein  55.56 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3782  VWA containing CoxE family protein  58.73 
 
 		 390 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858588  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3906  hypothetical protein  56.57 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1642  hypothetical protein  55.67 
 
 		 392 aa  454  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3321  hypothetical protein  55.81 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4135  hypothetical protein  54.55 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1913  hypothetical protein  54.04 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0562302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02166  hypothetical protein  53.16 
 
 		 393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1409  hypothetical protein  55.92 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6258  hypothetical protein  53.54 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1983  hypothetical protein  56.31 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2124  hypothetical protein  53.79 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.466092  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3459  hypothetical protein  54.04 
 
 		 411 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0190687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2057  hypothetical protein  51.27 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0516  hypothetical protein  59.49 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3297  hypothetical protein  54.2 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.88869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2871  hypothetical protein  54.41 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2685  hypothetical protein  53.63 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4250  hypothetical protein  54.25 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2536  hypothetical protein  55.56 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129382  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2093  hypothetical protein  54.66 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1945  hypothetical protein  56.31 
 
 		 391 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1511  hypothetical protein  54.31 
 
 		 391 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1879  hypothetical protein  53 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.453094  normal  0.342483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0891  hypothetical protein  53.63 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0553053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4979  hypothetical protein  55.58 
 
 		 391 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.042222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6601  hypothetical protein  55.81 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4465  hypothetical protein  54.57 
 
 		 391 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4929  hypothetical protein  54.57 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3988  VWA containing CoxE family protein  52.14 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6064  hypothetical protein  54.04 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2650  hypothetical protein  54.14 
 
 		 394 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1307  hypothetical protein  53.88 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1718  hypothetical protein  48.56 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0616459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0803  hypothetical protein  49.14 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0810  hypothetical protein  49.14 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.487209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1187  hypothetical protein  52.63 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  42.96 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0107  hypothetical protein  42.57 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.183182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2133  hypothetical protein  41.15 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000802256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3607  hypothetical protein  41.04 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2235  VWA containing CoxE family protein  36.7 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0048  hypothetical protein  36.03 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0438  hypothetical protein  35.96 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1614  hypothetical protein  34.08 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2766  hypothetical protein  20.97 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2506  VWA containing CoxE family protein  27.18 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1429  hypothetical protein  20.4 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3718  hypothetical protein  22.63 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.625161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  21.65 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>