23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3112 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  36.55 
 
 		 166 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  39.6 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  36.65 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  38.15 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  36.99 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  34.1 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  38.73 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  36.02 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  34.03 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  34.25 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  39.31 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  39.31 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  39.13 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  32.52 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  27.74 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  23.01 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  26.05 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  27.22 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  26.05 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  42.55 
 
 		 58 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>