More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3091 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  65.21 
 
 
472 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  69.49 
 
 
471 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  70.92 
 
 
469 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  77.87 
 
 
469 aa  765    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  70.92 
 
 
469 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  70.92 
 
 
469 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  80.04 
 
 
485 aa  788    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  71.28 
 
 
470 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  70.71 
 
 
468 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  70.92 
 
 
490 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  70.54 
 
 
468 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  70.97 
 
 
469 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  70.92 
 
 
469 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  80.76 
 
 
486 aa  794    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  70.75 
 
 
469 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  100 
 
 
476 aa  974    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  65.75 
 
 
472 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  70.5 
 
 
469 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  80.42 
 
 
493 aa  786    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  77.02 
 
 
483 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  79.54 
 
 
469 aa  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  69.64 
 
 
468 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  70.29 
 
 
489 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  70.3 
 
 
469 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  70.71 
 
 
469 aa  668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  70.75 
 
 
469 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  68.66 
 
 
471 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  80.76 
 
 
486 aa  794    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  69.08 
 
 
471 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  70.11 
 
 
490 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  70.54 
 
 
469 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  70.75 
 
 
469 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  79.62 
 
 
465 aa  776    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  75.05 
 
 
488 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  70.92 
 
 
469 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  81.4 
 
 
467 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  67.48 
 
 
462 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  66.02 
 
 
476 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  66.6 
 
 
485 aa  618  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  63.37 
 
 
468 aa  614  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  65.23 
 
 
463 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  60.34 
 
 
464 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  59.58 
 
 
464 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  59.2 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  60.09 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  58.74 
 
 
468 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  58.95 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  58.95 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  59.31 
 
 
462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  58.95 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 
464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  58.92 
 
 
464 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  58.32 
 
 
464 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  56.84 
 
 
469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  58.64 
 
 
468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  58.79 
 
 
469 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  57.42 
 
 
491 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  57.29 
 
 
466 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  57.88 
 
 
457 aa  553  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  57.68 
 
 
467 aa  551  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  57.88 
 
 
457 aa  553  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  59.35 
 
 
478 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  57.86 
 
 
467 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  59.83 
 
 
475 aa  551  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  57.76 
 
 
467 aa  545  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  57.98 
 
 
465 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  54.16 
 
 
458 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  56.3 
 
 
465 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  53 
 
 
458 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  53.66 
 
 
458 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  52.58 
 
 
461 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  52.7 
 
 
458 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 
458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  52.27 
 
 
458 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  52.7 
 
 
458 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 
462 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 
462 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
458 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  48.17 
 
 
459 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 
459 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
460 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
464 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  51.83 
 
 
455 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  51.63 
 
 
463 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  48.95 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
459 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  49.25 
 
 
466 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
461 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  50.97 
 
 
463 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  50 
 
 
469 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
481 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  50.32 
 
 
466 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  49.69 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  52.8 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  49.06 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  51.07 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  49.48 
 
 
467 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 
466 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  50.85 
 
 
462 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>