More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3076 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  35.74 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  30.82 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  30.19 
 
 		 306 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 510 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 627 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.47 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.41 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.1 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.27 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  26.7 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  21.62 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.49 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  24.1 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  23.26 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  25.88 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  31.3 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 1015 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.92 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  28.92 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  21.2 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 594 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 1001 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.26 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 434 aa  58.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  35.04 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.29 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  37.31 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>