65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3045 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 130 aa  256  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  40.71 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  36.19 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  32.69 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  36.07 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  35.2 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  30.97 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  39.34 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  37.14 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  36.46 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  34.29 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  36.19 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  29.52 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  32.74 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  34.38 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  34.38 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  34.38 
 
 		 311 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  28.7 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  31.07 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  32.5 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  39.19 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  21.93 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  32.26 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  37.18 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  24.14 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  30.12 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  30.39 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  30.93 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  30.93 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  37.8 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  32.32 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  33.68 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  33.68 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  31.73 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  36.71 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  28.42 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  30.48 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  28.41 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  31.63 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  35.94 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  27.93 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  31.43 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  35.94 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  23.48 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  26.19 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  35.45 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  32.47 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  30.38 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  29.47 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  35.71 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  32.91 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  33.75 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  37.5 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  34.41 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  30.3 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  41.94 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  37.5 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  31.58 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  28.72 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  32.14 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>