22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2957 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  47.4 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  40.72 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  44.04 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  45.4 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  42.46 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.7 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  37.7 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  41.27 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  31.18 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  32.47 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  27.72 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  30.97 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  30.99 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  26.35 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  27.61 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>