More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2938 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  803    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  75.77 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  60.96 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  61.96 
 
 		 394 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  61.21 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  60.45 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  61.1 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  59.15 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  59.85 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  60.96 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  61.07 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  59.85 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  59.09 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  58.08 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  55.08 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  57.93 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  54.57 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  57.58 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  57.83 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  58.33 
 
 		 397 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  58.33 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  58.33 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  58.33 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  58.33 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  58.33 
 
 		 397 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  58.46 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  58.33 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  58.93 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  58.42 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  58.97 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  58.46 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  58.46 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  58.21 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  47.94 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  51.26 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  47.83 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  47.18 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  47.18 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  50.7 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  43.9 
 
 		 410 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  48.97 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  43.73 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  46.15 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  48.21 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  48.2 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  46.92 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  50.88 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  45.01 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  46.67 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  48.35 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  48.6 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.17 
 
 		 407 aa  325  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  47.78 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  47.68 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  47.42 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  47.42 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  43.73 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  47.33 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  44.94 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  40.26 
 
 		 381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  37.78 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  35.86 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  37.91 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  36.43 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  36.16 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  36.17 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  33.67 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  39.63 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  39.63 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  34.1 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 406 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  40.87 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  38.89 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 		 365 aa  243  6e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  38.95 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  36.48 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  39.37 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  37.53 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  38.48 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  37.7 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  39.48 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  37.53 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  38.6 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  37.79 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  39.48 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  39.48 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  39.48 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  39.18 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  37.18 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>