More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2928 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  70.07 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 154 aa  204  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  62.59 
 
 		 147 aa  197  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 149 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 155 aa  187  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  59.18 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 170 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  59.86 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 159 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 159 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  57.64 
 
 		 165 aa  166  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  53.06 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  53.74 
 
 		 172 aa  163  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  52.41 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  51.39 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  50.69 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 174 aa  154  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  51.39 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 152 aa  153  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2166  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.13572  normal  0.0195727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  50.69 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>