More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2899 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  85.71 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2112  nitrogen regulatory protein P-II  91.96 
 
 		 112 aa  191  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  190  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  187  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  180  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2310  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 114 aa  174  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  74.11 
 
 		 114 aa  173  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1700  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  87.5 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75.89 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>