More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2812 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  100 
 
 
288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  79.51 
 
 
294 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  76.06 
 
 
294 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  72.82 
 
 
293 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  72.57 
 
 
294 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  72.82 
 
 
293 aa  417  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  71.68 
 
 
286 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  72.92 
 
 
290 aa  411  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  72.44 
 
 
294 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  74.91 
 
 
294 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  66.9 
 
 
298 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  67.61 
 
 
297 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  67.61 
 
 
297 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  67.61 
 
 
297 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  67.25 
 
 
297 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  67.25 
 
 
297 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  67.25 
 
 
297 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  63.07 
 
 
296 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
296 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
296 aa  381  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
296 aa  381  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  63.07 
 
 
296 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  67.13 
 
 
297 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  66.55 
 
 
298 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
296 aa  381  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
296 aa  381  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  66.2 
 
 
298 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
296 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.29 
 
 
296 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  66.55 
 
 
297 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.76 
 
 
293 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1531  phosphate transporter permease subunit PtsA  64.34 
 
 
294 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  62.46 
 
 
296 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  62.11 
 
 
296 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  62.11 
 
 
296 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.85 
 
 
297 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.49 
 
 
300 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.85 
 
 
297 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.85 
 
 
297 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.85 
 
 
297 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  62.46 
 
 
296 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  62.11 
 
 
296 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  60.76 
 
 
296 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  69.17 
 
 
300 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.38 
 
 
297 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.85 
 
 
297 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1716  phosphate transporter permease subunit PtsA  65.73 
 
 
294 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.64 
 
 
295 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.64 
 
 
295 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.64 
 
 
295 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2024  phosphate transporter permease subunit PtsA  66.91 
 
 
294 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.433371  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
295 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  63.29 
 
 
295 aa  360  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  64.41 
 
 
295 aa  358  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4001  phosphate transporter permease subunit PtsA  62.94 
 
 
296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.87 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.78 
 
 
284 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2831  phosphate ABC transporter permease protein  61.19 
 
 
283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.43 
 
 
299 aa  317  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.91 
 
 
284 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  55.91 
 
 
284 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2221  phosphate ABC transporter permease  58.97 
 
 
304 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.155385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1334  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.6 
 
 
285 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812024  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  55.6 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1928  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  57.51 
 
 
304 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0575886  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0837  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3410  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60 
 
 
279 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1309  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.03 
 
 
287 aa  295  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00541  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  55.56 
 
 
289 aa  295  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3267  phosphate ABC transporter, permease protein  57.46 
 
 
290 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  54.84 
 
 
287 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.23 
 
 
277 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.84 
 
 
287 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3104  phosphate ABC transporter permease  57.09 
 
 
294 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.354124  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1795  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.57 
 
 
280 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0203685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4921  phosphate ABC transporter permease  56.51 
 
 
300 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1988  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  57.2 
 
 
291 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0778  phosphate ABC transporter permease  57.78 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0508  phosphate transport system permease protein 2  57.84 
 
 
281 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.782199 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  47.81 
 
 
281 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7426  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.21 
 
 
312 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0637  phosphate ABC transporter permease  55.93 
 
 
281 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.48 
 
 
304 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0890  phosphate ABC transporter permease  55.51 
 
 
286 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2342  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.45 
 
 
296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367427  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.64 
 
 
301 aa  268  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.64 
 
 
301 aa  268  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.57 
 
 
279 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.239867  normal  0.961378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
280 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
280 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5254  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.82 
 
 
297 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.61 
 
 
280 aa  262  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4715  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.1 
 
 
279 aa  261  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5182  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.45 
 
 
297 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.42 
 
 
280 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.42 
 
 
280 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.25 
 
 
277 aa  257  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5264  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.72 
 
 
287 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  45.05 
 
 
279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0182  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.24 
 
 
279 aa  232  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000204999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>