More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2798 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  100 
 
 		 416 aa  825    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  59.29 
 
 		 391 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  58.84 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  52.03 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  51.02 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  51.02 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  48.24 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  49.37 
 
 		 396 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  52 
 
 		 390 aa  338  9e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  53.59 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  49.87 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  49.12 
 
 		 400 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  48.51 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  50.25 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  48.64 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  50.87 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  47.03 
 
 		 408 aa  328  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  50.13 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  46.02 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  48.89 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  48.53 
 
 		 401 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  49.49 
 
 		 398 aa  326  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  47.77 
 
 		 393 aa  325  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  45.89 
 
 		 393 aa  325  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  49.37 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  51.23 
 
 		 404 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  48.75 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  45.98 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  47.55 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  48.5 
 
 		 1305 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  46.91 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  46.52 
 
 		 392 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  49.25 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  49.12 
 
 		 400 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  47.24 
 
 		 393 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  52.32 
 
 		 385 aa  315  9e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  48.03 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  51.26 
 
 		 1230 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  45.01 
 
 		 402 aa  312  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  46.5 
 
 		 394 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  49.25 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  47.26 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.79 
 
 		 407 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  48.98 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.56 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  47.99 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  47.99 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  46.21 
 
 		 382 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  50.12 
 
 		 399 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  45.84 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  46.57 
 
 		 400 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  45.84 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  48 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  50.25 
 
 		 1230 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  47.26 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  47.26 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  47.26 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  43.39 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  47.03 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  50.64 
 
 		 399 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  49.25 
 
 		 1228 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  43.24 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  47.01 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  47.01 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  47.01 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  50 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  50 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  46.55 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  45.43 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  46.55 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  48.49 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  47.55 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  45.86 
 
 		 391 aa  292  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  44.94 
 
 		 397 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  45.27 
 
 		 396 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  46.29 
 
 		 402 aa  289  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  44.8 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  43.98 
 
 		 404 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  38.21 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  43 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  43.64 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  40.49 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  39.9 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  39.9 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  40.1 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  40.69 
 
 		 410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  42.75 
 
 		 583 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  39.11 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  40.75 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  43.04 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  38.73 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  39.41 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  39.45 
 
 		 410 aa  266  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3238  acetate kinase  43.25 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  41.04 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  42.23 
 
 		 402 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  37.91 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  37.68 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  37.68 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>