More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2772 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  82.7 
 
 		 269 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 247 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  71.37 
 
 		 242 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.64 
 
 		 239 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.31 
 
 		 262 aa  355  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  70.74 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  68.7 
 
 		 265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  66.38 
 
 		 247 aa  332  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.87 
 
 		 223 aa  316  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.66 
 
 		 246 aa  314  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.85 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.76 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.05 
 
 		 257 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.05 
 
 		 257 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.05 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.16 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.16 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.16 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.12 
 
 		 403 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 259 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.48 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.65 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.21 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 267 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  51.77 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.16 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.73 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.73 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 248 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  51.56 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 630 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.29 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  52.47 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  48.89 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  51.82 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  51.82 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.91 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.51 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 265 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2471  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185946  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.73 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3034  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  44.1 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1703  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0806739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.92 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  43.51 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  43.51 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  44.05 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  43.24 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  44.49 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2293  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.67 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.49 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  43.69 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.67 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1833  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.67 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003475  fumarate and nitrate reduction regulatory protein  43.69 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.292896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>