More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2744 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  885    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000449051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 		 757 aa  319  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 632 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000223104  hitchhiker  0.0000247295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 718 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 695 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 701 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 815 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 874 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  36.33 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 958 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 546 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  36.97 
 
 		 867 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  30.15 
 
 		 827 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 880 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 637 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 905 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.11 
 
 		 587 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.77 
 
 		 587 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 581 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  30.49 
 
 		 587 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 587 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 587 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 1010 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 587 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 911 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 587 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30.49 
 
 		 587 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 585 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 1319 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 587 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 556 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 585 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  32.3 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1021 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 523 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 885 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  29.71 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 590 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 		 484 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 608 aa  147  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 587 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 589 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 816 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 979 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  29.8 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  35.77 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  33.84 
 
 		 1355 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 582 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  34.11 
 
 		 582 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 556 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 770 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  36.47 
 
 		 576 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  33.2 
 
 		 982 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 597 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 1131 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 590 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  40 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  28.29 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  35.16 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  30.81 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 612 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.47 
 
 		 617 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 650 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1002 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 608 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  37.64 
 
 		 435 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  28.95 
 
 		 591 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  35.98 
 
 		 648 aa  140  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 599 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 643 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 646 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 487 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  34.98 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  30.03 
 
 		 810 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 755 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 754 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 597 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>