273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2725 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
640 aa  1255    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  51.54 
 
 
653 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  41.01 
 
 
644 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  40.15 
 
 
642 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  38.7 
 
 
672 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  36.86 
 
 
691 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  37.48 
 
 
658 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  37.73 
 
 
642 aa  361  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  36.24 
 
 
647 aa  340  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  35.66 
 
 
652 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  35.7 
 
 
631 aa  337  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  34.25 
 
 
645 aa  319  9e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  35.76 
 
 
637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  33.49 
 
 
645 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  33.49 
 
 
645 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  32.51 
 
 
681 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  33.13 
 
 
631 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 
667 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 
667 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 
667 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 
667 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 
667 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 
667 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 
714 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  33.44 
 
 
638 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 
641 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  34.78 
 
 
642 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  33.82 
 
 
667 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 
659 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.56 
 
 
682 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  35.45 
 
 
629 aa  279  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  34.24 
 
 
643 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  34.24 
 
 
643 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  34.24 
 
 
643 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
657 aa  273  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.76 
 
 
683 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  32.51 
 
 
683 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  33.53 
 
 
660 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  29.67 
 
 
682 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  33.97 
 
 
665 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  31.7 
 
 
657 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  33.82 
 
 
665 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
688 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  32.47 
 
 
685 aa  259  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
680 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  31.53 
 
 
657 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 
676 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  31.11 
 
 
641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.23 
 
 
641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.6 
 
 
680 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  31.73 
 
 
641 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.01 
 
 
681 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  31.27 
 
 
641 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  30.54 
 
 
638 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  31.42 
 
 
641 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
686 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  31.65 
 
 
641 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  31.64 
 
 
641 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  33.49 
 
 
640 aa  248  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  31.27 
 
 
641 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
686 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  32.36 
 
 
639 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  29.73 
 
 
640 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
660 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  29.19 
 
 
642 aa  234  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  32.83 
 
 
624 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  32.83 
 
 
624 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 
640 aa  231  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
638 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
637 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  29.3 
 
 
626 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  29.39 
 
 
638 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.27 
 
 
695 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  32.32 
 
 
920 aa  220  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  30.84 
 
 
626 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  29.75 
 
 
665 aa  217  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  32.15 
 
 
554 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  32.15 
 
 
554 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  32.15 
 
 
554 aa  213  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  27.9 
 
 
624 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  32.97 
 
 
546 aa  210  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 
637 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
547 aa  207  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
547 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  31.73 
 
 
547 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  31.79 
 
 
547 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
547 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  31.79 
 
 
547 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
547 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  28.34 
 
 
646 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  31.57 
 
 
547 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.57 
 
 
547 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 
553 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 
553 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 
553 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 
553 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 
553 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  33.64 
 
 
541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  31.84 
 
 
548 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  30.88 
 
 
539 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>