283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2724 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 405 aa  808    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  47.39 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  40.29 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  38.96 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  38.44 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  36.43 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  36.79 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  36.41 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  35.37 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  33.09 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  29.95 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.35 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  33.25 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  33.25 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  31.33 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  29.16 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  31.68 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  28.88 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  29.61 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.76 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.26 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  31.1 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  27.71 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  33.18 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.29 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  29.51 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.36 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.12 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  26.29 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  27.29 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.6 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.77 
 
 		 408 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  28.09 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  31.26 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  28.93 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  26.07 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  29.9 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  26.3 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  28.5 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  26.74 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.65 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  29.43 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  27.68 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  26.01 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  27.67 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  27.25 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  29.98 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  29.98 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  32.1 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  25.12 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  30.04 
 
 		 521 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  34.02 
 
 		 319 aa  96.3  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  27.5 
 
 		 562 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  33.77 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  33.77 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  33.77 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  33.77 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  33.77 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  38.51 
 
 		 326 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  24.15 
 
 		 341 aa  93.2  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  32.66 
 
 		 302 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  27.55 
 
 		 520 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  30.73 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 		 304 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.68 
 
 		 521 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  28.85 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3573  flagellar hook-associated protein 3  24.78 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  30.21 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  30.57 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  29.17 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.57 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  29.17 
 
 		 317 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.07 
 
 		 524 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  30.57 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  32.32 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  29.23 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2353  flagellar hook-associated protein FlgL  24.59 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  32.45 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  29.01 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  29.67 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>