More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2676 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  85.17 
 
 		 418 aa  711    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  83.58 
 
 		 403 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  826    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  71.01 
 
 		 416 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  72.75 
 
 		 421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  69.95 
 
 		 418 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  74.5 
 
 		 433 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  68.9 
 
 		 421 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  69.17 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  70.43 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  69.44 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  44.25 
 
 		 404 aa  312  9e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  44.76 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  43.73 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  42.35 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  41.73 
 
 		 403 aa  282  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  42.86 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  43.37 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  43.88 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  43.62 
 
 		 411 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  41.58 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  43.62 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  42.49 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  42.24 
 
 		 403 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  41.33 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  39.23 
 
 		 424 aa  242  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  32.03 
 
 		 455 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 455 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  29.24 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  29.9 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  31.12 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  31.12 
 
 		 431 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 420 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  31.15 
 
 		 905 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 425 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  28.11 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  27.84 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 389 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.21 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 435 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 443 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  32.7 
 
 		 424 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  33.08 
 
 		 424 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  29.75 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  27.02 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  26.74 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  26.74 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  26.74 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  26.74 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30.85 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  29.75 
 
 		 426 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.75 
 
 		 426 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  26.74 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  26.74 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  32.7 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  26.74 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.09 
 
 		 895 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  28.29 
 
 		 912 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.69 
 
 		 417 aa  136  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  31.77 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 472 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 453 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  33.45 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  32.35 
 
 		 917 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>