More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2640 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 293 aa  597  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  80.2 
 
 		 293 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  76.29 
 
 		 298 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  74.57 
 
 		 298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  74.83 
 
 		 297 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  74.15 
 
 		 323 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  73.97 
 
 		 298 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  73.97 
 
 		 298 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  72.79 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  71.43 
 
 		 296 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  71.82 
 
 		 296 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 294 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 320 aa  410  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  68.28 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  66.21 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  68.28 
 
 		 301 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  65.19 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  66.9 
 
 		 300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  66.21 
 
 		 294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  68.28 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  62.93 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  63.45 
 
 		 292 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  61.46 
 
 		 290 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  65.05 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  59.72 
 
 		 296 aa  353  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 		 292 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 		 292 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 		 292 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 		 292 aa  345  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  58.28 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  58.39 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 		 292 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 		 292 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  61.25 
 
 		 300 aa  331  8e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  58.19 
 
 		 290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  58.19 
 
 		 290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 		 292 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  55.05 
 
 		 292 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  55.29 
 
 		 295 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  52.43 
 
 		 302 aa  319  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  55.29 
 
 		 295 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  54.3 
 
 		 292 aa  318  7e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  54.61 
 
 		 295 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 		 291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  51.4 
 
 		 286 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  51.74 
 
 		 292 aa  304  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  52.43 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 		 292 aa  301  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  51.57 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  51.89 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 		 292 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 		 292 aa  298  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  298  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  51.74 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  51.74 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  52.98 
 
 		 291 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  52.98 
 
 		 291 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 290 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  53.82 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>