228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2627 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 425 aa  873    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  36.32 
 
 		 216 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 222 aa  136  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  42.31 
 
 		 207 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  44.3 
 
 		 228 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  34.73 
 
 		 193 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  34.41 
 
 		 218 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  31.98 
 
 		 218 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  34.54 
 
 		 193 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  39.75 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 218 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  32.78 
 
 		 218 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 		 340 aa  117  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 327 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  36.18 
 
 		 194 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.36 
 
 		 207 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  34.1 
 
 		 235 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 221 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 221 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  37.8 
 
 		 208 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  34.81 
 
 		 221 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  33.77 
 
 		 198 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 217 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  29.73 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  27.89 
 
 		 197 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  27.89 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  27.89 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  27.89 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  27.89 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  27.89 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 188 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.84 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  38.14 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  32.14 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 		 194 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  33.59 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  34.65 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  34.65 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  34.65 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.65 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.65 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  34.65 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  34.65 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  34.65 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  24.19 
 
 		 197 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  30.33 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  34.94 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  25.52 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  24.6 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  27.12 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  28.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 208 aa  57  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  30.39 
 
 		 243 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.39 
 
 		 205 aa  57  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 220 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 199 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  29.17 
 
 		 182 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  30.18 
 
 		 207 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  27.49 
 
 		 203 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  25.5 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 199 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 187 aa  54.3  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 		 215 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 241 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 		 213 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  26.35 
 
 		 231 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  29.81 
 
 		 197 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  26.75 
 
 		 217 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.7 
 
 		 626 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 		 248 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  25.53 
 
 		 218 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>