More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2602 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  478  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  84.51 
 
 
255 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  78.76 
 
 
230 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  75.66 
 
 
230 aa  374  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  75.88 
 
 
234 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  77.88 
 
 
230 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  73.04 
 
 
230 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  76.11 
 
 
230 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  71.74 
 
 
230 aa  359  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.17 
 
 
230 aa  357  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.74 
 
 
230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.12 
 
 
230 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  72.12 
 
 
230 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.12 
 
 
230 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  70.43 
 
 
234 aa  351  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.43 
 
 
230 aa  349  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.8 
 
 
230 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.2 
 
 
242 aa  343  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.52 
 
 
233 aa  338  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  64.38 
 
 
233 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.95 
 
 
236 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  58.26 
 
 
234 aa  285  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  62.86 
 
 
228 aa  272  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.31 
 
 
232 aa  271  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  59.56 
 
 
230 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.93 
 
 
235 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.89 
 
 
231 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.52 
 
 
263 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.7 
 
 
235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  55.95 
 
 
239 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  58.33 
 
 
233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  57.21 
 
 
229 aa  265  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  57.27 
 
 
232 aa  265  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  55.93 
 
 
235 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  59.51 
 
 
204 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  63.24 
 
 
211 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.24 
 
 
211 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.39 
 
 
231 aa  263  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  56.33 
 
 
229 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  56.17 
 
 
235 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  55.08 
 
 
235 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  62.25 
 
 
211 aa  262  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.17 
 
 
237 aa  262  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  56.96 
 
 
239 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  58.15 
 
 
233 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.27 
 
 
233 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  58.59 
 
 
229 aa  258  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.94 
 
 
233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  56.47 
 
 
235 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  55.56 
 
 
233 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  58.74 
 
 
213 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.27 
 
 
235 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.54 
 
 
208 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.31 
 
 
211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.39 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  58.54 
 
 
209 aa  251  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  54.39 
 
 
236 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  56.8 
 
 
213 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  54.67 
 
 
239 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  54.02 
 
 
239 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  55.8 
 
 
237 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  56.65 
 
 
223 aa  248  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  54.39 
 
 
236 aa  248  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  55.46 
 
 
229 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  58.45 
 
 
209 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  54.46 
 
 
235 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  54.72 
 
 
214 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  52.81 
 
 
229 aa  244  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.02 
 
 
209 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.62 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.67 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  53.74 
 
 
233 aa  241  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  52.84 
 
 
232 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  57.28 
 
 
235 aa  240  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.35 
 
 
206 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  53.3 
 
 
232 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  53.3 
 
 
232 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  53.3 
 
 
232 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  56.37 
 
 
222 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  53.3 
 
 
232 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.94 
 
 
222 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  53.3 
 
 
232 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  53.3 
 
 
232 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.37 
 
 
207 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  55.12 
 
 
208 aa  235  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  56.86 
 
 
208 aa  235  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  52.19 
 
 
232 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  51.56 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  56.65 
 
 
215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  56.65 
 
 
215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.95 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.95 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  54.95 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  49.58 
 
 
240 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.4 
 
 
233 aa  232  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>