More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2569 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  80.25 
 
 		 319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  81.5 
 
 		 319 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  73.04 
 
 		 319 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  79.31 
 
 		 319 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  79.94 
 
 		 319 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  79.94 
 
 		 319 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  77.12 
 
 		 319 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  75.24 
 
 		 319 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  58.28 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  58.08 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  49.06 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  48.52 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  48.58 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  50.67 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  47.95 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  48.26 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  47.95 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  47.39 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  46.25 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  48.29 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  48.29 
 
 		 314 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  47.26 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  44.76 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  45.21 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  43.15 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  40.26 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  38.48 
 
 		 341 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  39.39 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  45.04 
 
 		 330 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  41.55 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  41.43 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  36 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  40.44 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  41.76 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  37.33 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  37.8 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  36.99 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  36.77 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  41.28 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  36.43 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  36.64 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  35.09 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  36.58 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  36.3 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  36.3 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  37.92 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  36.43 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  36.21 
 
 		 335 aa  188  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  34.47 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  33.68 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  32.39 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  33.84 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  33.23 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  34.69 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  32.4 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  33.22 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  31.76 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  32.06 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  35.13 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  32.38 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  32.99 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  32.75 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  31.35 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  33.09 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  33.33 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.69 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.69 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  32 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  31.97 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  31.21 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  30.74 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  29.05 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  30.98 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  30.5 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  29.37 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  30.41 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  30.41 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  30.28 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  30.07 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  28.17 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  30.8 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  28.17 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  27.86 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  27.86 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  27.86 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  29.69 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  31.86 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  29.65 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  29.05 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  30.53 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>