52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2493 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  73.26 
 
 		 166 aa  235  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.09 
 
 		 165 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.09 
 
 		 165 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  71.1 
 
 		 194 aa  233  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  72.09 
 
 		 166 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  67.72 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  69.18 
 
 		 163 aa  204  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.09 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.55 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.3 
 
 		 163 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.3 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.72 
 
 		 163 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.72 
 
 		 163 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  57.65 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  52.87 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  53.21 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  43.02 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  35.47 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  39.16 
 
 		 151 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  36.42 
 
 		 154 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  35.26 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  35.84 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  36.05 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  38.55 
 
 		 150 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  38.55 
 
 		 150 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  34.5 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  36.14 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  35.5 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  36.08 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  33.96 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  34.76 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  32.93 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  32.75 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  34.13 
 
 		 150 aa  72  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  32.75 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  33.73 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  32.69 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  32.69 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  35.16 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  34.07 
 
 		 82 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  33.7 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  28.85 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  26.78 
 
 		 165 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.93 
 
 		 160 aa  42  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  26.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.88 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  30.1 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>