45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2435 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  50.85 
 
 
240 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  52.1 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  42.6 
 
 
219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  42.6 
 
 
219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  42.6 
 
 
219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  42.6 
 
 
219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  42.15 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  41.01 
 
 
221 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  39.65 
 
 
230 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  35.93 
 
 
217 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  34.75 
 
 
221 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  47.06 
 
 
129 aa  101  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  33.13 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  28.27 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  30.86 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  23.43 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  26.26 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  27.95 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  26.94 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  29.11 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  31.72 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  26.76 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  29.58 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  26.25 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  35.66 
 
 
217 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01424  hypothetical protein  52.94 
 
 
52 aa  55.1  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  32.08 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  30.12 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  25.95 
 
 
232 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  25.91 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  26.25 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  29.14 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  26.74 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  34.11 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  32.7 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  26.9 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  32.08 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>