182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2431 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 367 aa  704    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  59.54 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  42 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  42 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  40.17 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  37.46 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  39.6 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  43.98 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  41.74 
 
 		 376 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 		 410 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  42.99 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  42.17 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  35.44 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  42.61 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  40.17 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.74 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  40.97 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 378 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  39.5 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  40.52 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  40.57 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  40.57 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  40.57 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  40.57 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  40.57 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  40.57 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  40.57 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 		 378 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 374 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  38.22 
 
 		 346 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  38.44 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  36.18 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  38.04 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  36.23 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  37.68 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  34.1 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  36.96 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  34.1 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  36.81 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  33.14 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  34.67 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  35.24 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  37.43 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.11 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 382 aa  99.4  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  32.1 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.68 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 388 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  30.57 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  30.42 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  29.36 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 404 aa  86.3  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  29.75 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  32.47 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.37 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.87 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  30.13 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  30.71 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29.62 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  29.3 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  30.37 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  29.08 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  31.27 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  27.85 
 
 		 454 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  32.1 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.2 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.2 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  29.48 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  30.92 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.54 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.41 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  27.15 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.2 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>