More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2217 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  801    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  67.68 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  67.43 
 
 		 364 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  64.86 
 
 		 393 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  66.29 
 
 		 365 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  64.46 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  73.94 
 
 		 372 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  58.68 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  71.19 
 
 		 367 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  62.23 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  65.25 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  66.42 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  70.8 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  66.42 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  69.8 
 
 		 298 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  61.37 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  67.31 
 
 		 329 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  68.08 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  68.08 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  68.25 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  68 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  65.43 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  68.24 
 
 		 327 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  65.76 
 
 		 263 aa  363  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  63.85 
 
 		 314 aa  362  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  64.75 
 
 		 297 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  64.31 
 
 		 296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  63.71 
 
 		 311 aa  356  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  67.07 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  64.48 
 
 		 303 aa  352  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  65.37 
 
 		 296 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  62.26 
 
 		 316 aa  348  7e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  62.69 
 
 		 304 aa  347  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  63.46 
 
 		 310 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  64.66 
 
 		 314 aa  344  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  62.26 
 
 		 328 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  53.72 
 
 		 301 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  60 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  62.95 
 
 		 294 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  62.95 
 
 		 294 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  62.95 
 
 		 294 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  58.05 
 
 		 296 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  62.33 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  60.34 
 
 		 276 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  52.94 
 
 		 299 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  54.69 
 
 		 300 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  57.32 
 
 		 295 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  57.51 
 
 		 293 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  58.41 
 
 		 281 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  62.67 
 
 		 285 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  56.08 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  56.8 
 
 		 289 aa  292  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  59.46 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  59.64 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  58.12 
 
 		 293 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  55.6 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  59.91 
 
 		 304 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  57.39 
 
 		 256 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  60.36 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  60.36 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  49.31 
 
 		 324 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  58.08 
 
 		 305 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  58.87 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  60.45 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  57.08 
 
 		 284 aa  285  9e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  54.02 
 
 		 314 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  47.04 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  59.46 
 
 		 316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  59.47 
 
 		 304 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  55.42 
 
 		 289 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  60.36 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  56.82 
 
 		 269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  58.56 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  57.64 
 
 		 513 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  59.73 
 
 		 300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  57.34 
 
 		 305 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  52.81 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  59.28 
 
 		 316 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  54 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  54 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  57.08 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  58.26 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  60.09 
 
 		 258 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  57.64 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  57.89 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  58.33 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  59.73 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  57.64 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  52.5 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  57.64 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  60.65 
 
 		 300 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  56.52 
 
 		 307 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  58.26 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  57.4 
 
 		 305 aa  279  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  57.21 
 
 		 308 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  57.21 
 
 		 310 aa  279  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  57.64 
 
 		 308 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  57.21 
 
 		 308 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  59.28 
 
 		 316 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  59.28 
 
 		 316 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>