More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2211 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 535 aa  1072    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2120  ABC transporter related  70.89 
 
 		 505 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0246641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  53.21 
 
 		 503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  53.43 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  52.89 
 
 		 510 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  52.39 
 
 		 537 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  51.21 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  48.81 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.2 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  48.41 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.98 
 
 		 495 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.33 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  45.71 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.97 
 
 		 516 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.06 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.45 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  42.32 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  45.56 
 
 		 511 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  42.49 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.55 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  45.29 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.94 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  42.4 
 
 		 500 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  45.14 
 
 		 861 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.89 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.02 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.17 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  45.36 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.17 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  43.37 
 
 		 516 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  43.37 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  43.17 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 525 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.17 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  42.54 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.17 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.17 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  43.37 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  43.37 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  43.37 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  42.97 
 
 		 501 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.14 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  39.31 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.59 
 
 		 505 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.23 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  43.29 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  43 
 
 		 501 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  42.34 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  43.63 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  41.73 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.34 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.02 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  40.56 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.34 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.06 
 
 		 520 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  39.36 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.43 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.2 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  43.55 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.49 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  41.2 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  42.42 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  40.82 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  43.79 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43.51 
 
 		 508 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.24 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.89 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  40.82 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.06 
 
 		 515 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  42.86 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  40.32 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.75 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.9 
 
 		 512 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 510 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.35 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.56 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.9 
 
 		 512 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.8 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.44 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>