More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2172 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  867    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  63.13 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  39.33 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  39.33 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  39.33 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  39.33 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  39.33 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  39.1 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  33.86 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 453 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 443 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 438 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 467 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 448 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.39 
 
 		 475 aa  117  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 457 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 440 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 423 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  28.24 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  28.24 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 443 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.18 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 432 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 440 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 542 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 578 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 453 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 440 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 536 aa  97.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 452 aa  97.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 439 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 437 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>