109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2164 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  100 
 
 		 368 aa  712    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  51.46 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  52.13 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  51.62 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.06 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  51.03 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  46.53 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  49.68 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  40.67 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  41.36 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.5 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  43.33 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.27 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  42.5 
 
 		 342 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  37.99 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  45.9 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  42.19 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  39.34 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  41.59 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  41.9 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  39.34 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.84 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  37.19 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  35.4 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  33.43 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  39.56 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.03 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  33.16 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  34.06 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  28.72 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 342 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.69 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  32.72 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.89 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.04 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  32.04 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  33.13 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.74 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.74 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.74 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  35.19 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.2 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.71 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.35 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  28.82 
 
 		 897 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  27.56 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  31.45 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.52 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  28.48 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  27.16 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  26.62 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  30.66 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  31.05 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  26.92 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.88 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  30.3 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  45.83 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  25.79 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  28.73 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  25.9 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  26.34 
 
 		 3794 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  24.3 
 
 		 614 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.57 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  24.36 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  28.49 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  24.2 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  37.5 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  27.97 
 
 		 759 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  27.44 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  28.22 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  28.22 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  29.41 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.17 
 
 		 698 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  25.47 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2031  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2642  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235103  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  35.94 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  29.41 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  35.94 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2671  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.29 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 2082 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>