More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2146 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2146  aldo/keto reductase  100 
 
 
405 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32550  Aldo/keto reductase protein  64.25 
 
 
415 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  60.77 
 
 
401 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3243  aldo/keto reductase  60.23 
 
 
388 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  58.36 
 
 
331 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3904  twin-arginine translocation pathway signal  54.76 
 
 
385 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3215  aldo/keto reductase  57.91 
 
 
384 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  58.58 
 
 
329 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  58.11 
 
 
330 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  56.43 
 
 
329 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4369  aldo/keto reductase  63.16 
 
 
363 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  55.2 
 
 
335 aa  360  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  54.71 
 
 
329 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  55.36 
 
 
329 aa  359  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
382 aa  358  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0842  aldo/keto reductase  51.52 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495708  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  57.99 
 
 
330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.62 
 
 
327 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  54.87 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  55.12 
 
 
329 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
334 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  56.02 
 
 
327 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  53.33 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6149  aldo/keto reductase  55.99 
 
 
330 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  53.85 
 
 
327 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  55.42 
 
 
331 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  54.12 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.12 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.12 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.23 
 
 
334 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  53.69 
 
 
329 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  54.24 
 
 
328 aa  348  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  55.18 
 
 
325 aa  348  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.05 
 
 
329 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  53.1 
 
 
327 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  51.91 
 
 
331 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  51.9 
 
 
335 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  55.13 
 
 
329 aa  346  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  52.48 
 
 
334 aa  346  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1802  aldo/keto reductase  51.01 
 
 
372 aa  346  5e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.246141  normal  0.022853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  53.69 
 
 
331 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  50.44 
 
 
333 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  55.42 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  55.29 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  53.61 
 
 
329 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  54.52 
 
 
327 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  50.88 
 
 
334 aa  339  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  51.18 
 
 
327 aa  338  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  52.94 
 
 
327 aa  335  9e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  51.61 
 
 
331 aa  332  8e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  53.27 
 
 
342 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  52.79 
 
 
325 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  51.36 
 
 
328 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  49.4 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
331 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  53.11 
 
 
327 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
331 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  50.45 
 
 
344 aa  317  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  49.1 
 
 
321 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  49.42 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.29 
 
 
328 aa  299  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  43.94 
 
 
325 aa  296  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  47.94 
 
 
326 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  45.21 
 
 
328 aa  291  1e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
328 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  46.04 
 
 
333 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
331 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
330 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  48.34 
 
 
330 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  45.13 
 
 
333 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  46.82 
 
 
328 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
324 aa  272  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
328 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
325 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1160  aldo/keto reductase  41.11 
 
 
382 aa  266  4e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0226313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  47.32 
 
 
325 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
325 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  45.28 
 
 
332 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
331 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  43.58 
 
 
328 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
330 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  43.63 
 
 
330 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  43.92 
 
 
328 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  42.47 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  43.23 
 
 
340 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  45.2 
 
 
327 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
449 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  43.64 
 
 
328 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
328 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  40.66 
 
 
329 aa  256  5e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
317 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  43.44 
 
 
331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  44.88 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
330 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  44.62 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  44.69 
 
 
325 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
326 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
330 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>