145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2038 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  68.47 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  67.8 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  67.33 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  63.58 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  65.54 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  61.11 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  67.12 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  61.11 
 
 		 325 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  62.96 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  63.41 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  62.94 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  64.75 
 
 		 323 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  64.12 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  64.07 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  63.73 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  63.73 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.07 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.07 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.07 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  63.73 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.07 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  64.07 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  63.73 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  63.73 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  63.39 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  58.01 
 
 		 317 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  57.81 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  57.48 
 
 		 317 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  57.63 
 
 		 317 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  55.93 
 
 		 324 aa  345  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  55.59 
 
 		 341 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  55.93 
 
 		 341 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.73 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  56.31 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  57.39 
 
 		 321 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  54.24 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  51.63 
 
 		 321 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  54.85 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  53 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  54.08 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  52.23 
 
 		 321 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  51.36 
 
 		 349 aa  308  9e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  51.36 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  51.55 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.99 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  44.98 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  44.97 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  41.5 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  42.55 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  42.81 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  42.71 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.97 
 
 		 584 aa  230  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  38.97 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  39.31 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  38.25 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  46.09 
 
 		 270 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  37.54 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  39.08 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  37.3 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  40.44 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  38.31 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  40.49 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.5 
 
 		 319 aa  206  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  37.97 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  39.57 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.28 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  38.26 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  37.05 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  31.25 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  38.57 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  37.11 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  31.32 
 
 		 329 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.17 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  32.65 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  31.06 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  37.3 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  33.22 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  33.69 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.78 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  32.3 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  30.58 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  31.14 
 
 		 640 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  32.93 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.52 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  30.34 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  32 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  29.66 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  31.03 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  31.02 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  28.05 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  30.31 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  31.12 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.93 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  28.22 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  31.86 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  28.51 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  26.64 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  26.74 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>