More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2010 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  100 
 
 		 649 aa  1275    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  58.35 
 
 		 623 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  54.93 
 
 		 624 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.15 
 
 		 586 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  54.98 
 
 		 639 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  50.65 
 
 		 605 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  50.57 
 
 		 608 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  49.69 
 
 		 622 aa  531  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  46.38 
 
 		 626 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  47.39 
 
 		 615 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  47.39 
 
 		 615 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  47.07 
 
 		 611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  46.91 
 
 		 615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  49.77 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  47.07 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  49.92 
 
 		 632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  47.23 
 
 		 617 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  48.41 
 
 		 625 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  49.68 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.19 
 
 		 613 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  47.3 
 
 		 631 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  45.96 
 
 		 618 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  47.07 
 
 		 614 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  45.9 
 
 		 654 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  46.35 
 
 		 623 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.17 
 
 		 810 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  46.76 
 
 		 642 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  44.25 
 
 		 627 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  45.75 
 
 		 752 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.25 
 
 		 627 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  44.06 
 
 		 627 aa  465  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  44.97 
 
 		 627 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  46.87 
 
 		 648 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.25 
 
 		 627 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.25 
 
 		 627 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.25 
 
 		 627 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  44.25 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.03 
 
 		 789 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  43.64 
 
 		 610 aa  452  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  41.9 
 
 		 750 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.48 
 
 		 626 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  41.2 
 
 		 731 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  47.28 
 
 		 645 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  43.59 
 
 		 745 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.95 
 
 		 616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.95 
 
 		 616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  40.65 
 
 		 629 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  36.92 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  37.98 
 
 		 586 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  39.27 
 
 		 623 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  38.63 
 
 		 630 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  39.01 
 
 		 603 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.67 
 
 		 589 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.09 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.3 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.51 
 
 		 608 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.38 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.38 
 
 		 624 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.17 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  37.07 
 
 		 589 aa  365  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.82 
 
 		 595 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.82 
 
 		 595 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.96 
 
 		 595 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  37.87 
 
 		 577 aa  360  4e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.52 
 
 		 583 aa  359  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.16 
 
 		 619 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.73 
 
 		 610 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.96 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.16 
 
 		 619 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.96 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.2 
 
 		 628 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.24 
 
 		 611 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.8 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.04 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  35.49 
 
 		 575 aa  354  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.8 
 
 		 565 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.98 
 
 		 609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  37.8 
 
 		 565 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.99 
 
 		 619 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.94 
 
 		 565 aa  353  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.62 
 
 		 613 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.79 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.09 
 
 		 602 aa  351  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  37.78 
 
 		 565 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.38 
 
 		 565 aa  350  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.92 
 
 		 613 aa  349  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.56 
 
 		 604 aa  348  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.38 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.64 
 
 		 565 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.66 
 
 		 619 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.2 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.29 
 
 		 563 aa  345  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.38 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.21 
 
 		 567 aa  344  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.04 
 
 		 567 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.43 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.87 
 
 		 567 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.71 
 
 		 567 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  40 
 
 		 590 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.86 
 
 		 567 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>