More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2007 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  82.91 
 
 
241 aa  397  1e-110  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  78.97 
 
 
236 aa  380  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  74.25 
 
 
236 aa  358  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  74.89 
 
 
237 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  73.82 
 
 
237 aa  352  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  71.12 
 
 
264 aa  341  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  74.55 
 
 
237 aa  339  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  69.26 
 
 
237 aa  331  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  74.25 
 
 
238 aa  327  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  74.25 
 
 
238 aa  327  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  66.51 
 
 
279 aa  277  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  64.19 
 
 
279 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  63.26 
 
 
279 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  61.29 
 
 
281 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
281 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
281 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
281 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
281 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
281 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
454 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  61.29 
 
 
281 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  62.33 
 
 
281 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  60.83 
 
 
316 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  60.83 
 
 
316 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  61.86 
 
 
281 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
568 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  61.4 
 
 
281 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  61.4 
 
 
316 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  61.4 
 
 
284 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  60.47 
 
 
307 aa  254  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  59.07 
 
 
285 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  58.8 
 
 
285 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  59.07 
 
 
310 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  59.53 
 
 
279 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  56.28 
 
 
281 aa  234  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  56.02 
 
 
296 aa  228  9e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  56.6 
 
 
296 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  53.95 
 
 
275 aa  222  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  52.31 
 
 
302 aa  213  2e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 
278 aa  211  6e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.07909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 
276 aa  210  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  50.71 
 
 
326 aa  199  4e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  51.43 
 
 
280 aa  198  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
408 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  51.17 
 
 
404 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  46.95 
 
 
410 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 
326 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 
404 aa  191  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
411 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  48.34 
 
 
398 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  48.36 
 
 
406 aa  184  1e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  49.3 
 
 
289 aa  183  2e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 
405 aa  182  4e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 
438 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  47.89 
 
 
404 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 
298 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  48.36 
 
 
415 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  48.36 
 
 
404 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  49.31 
 
 
419 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  48.57 
 
 
298 aa  178  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.07 
 
 
410 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  48.57 
 
 
298 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  46.45 
 
 
398 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 
412 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  47.42 
 
 
404 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  47.2 
 
 
372 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.17789e-07  unclonable  3.04475e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
327 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  46.98 
 
 
410 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  47.78 
 
 
322 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
406 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.6 
 
 
292 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  46.51 
 
 
400 aa  175  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 
413 aa  175  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 
418 aa  174  1e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  46.51 
 
 
400 aa  174  1e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 
298 aa  173  2e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 
404 aa  173  2e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 
325 aa  173  2e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  46.01 
 
 
418 aa  172  3e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 
405 aa  171  6e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 
328 aa  171  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  48.1 
 
 
295 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 
405 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  46.67 
 
 
327 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 
298 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  46.48 
 
 
405 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  45.41 
 
 
296 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  46.92 
 
 
325 aa  168  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.54 
 
 
429 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.92 
 
 
432 aa  168  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  48.82 
 
 
407 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 
303 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
291 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  50.48 
 
 
297 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  47.62 
 
 
326 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>