197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1996 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  65.25 
 
 		 159 aa  180  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  56.21 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  62.59 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  63.7 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  61.87 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  59.12 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  56.52 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  53.33 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  52.67 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  54.07 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  54.07 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  51.13 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  57.85 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  56.56 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  55.71 
 
 		 167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  53.85 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  57.76 
 
 		 170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  50.36 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  60.78 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  52.55 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  45.07 
 
 		 162 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  44.9 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  51.22 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  48.39 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  52.67 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  46.77 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  50.41 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  48.2 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  43.75 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  45.04 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  50.49 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  45.21 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  40.83 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  98.6  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  49.06 
 
 		 319 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  43.7 
 
 		 185 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  43.17 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  38.85 
 
 		 307 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  41.26 
 
 		 179 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  38.64 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  42.4 
 
 		 320 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  39.86 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  44.03 
 
 		 342 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  39.02 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  37.96 
 
 		 351 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  37.96 
 
 		 334 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  36.71 
 
 		 178 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  43.9 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  41.98 
 
 		 199 aa  90.5  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  40.83 
 
 		 161 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  42.5 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  48.57 
 
 		 357 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  43.38 
 
 		 357 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  41.13 
 
 		 365 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  36.31 
 
 		 176 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  41.6 
 
 		 318 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  40.87 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  34.16 
 
 		 190 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  37.78 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  41.12 
 
 		 337 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  38.73 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  43.31 
 
 		 327 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  34.07 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  34.53 
 
 		 147 aa  84  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  42.98 
 
 		 321 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.62 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  35.61 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  37.96 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  37.88 
 
 		 323 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  41.46 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  37.33 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  39.31 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  30.4 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  35.82 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  38.32 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  37.38 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  43 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  37.1 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  39.64 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  35.93 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  38.17 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  30.94 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.46 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  36.11 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  40.78 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  34.69 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  43 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  36 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>