More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1949 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  100 
 
 		 250 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  64.13 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  68.28 
 
 		 146 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  68.53 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  68.06 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  66.9 
 
 		 146 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  65.24 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  74.19 
 
 		 203 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  74.22 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  67.36 
 
 		 221 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  74.22 
 
 		 262 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  72.58 
 
 		 148 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  53.21 
 
 		 289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  61.24 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  72.58 
 
 		 147 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  72.58 
 
 		 147 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  72.58 
 
 		 147 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  72.58 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  72.58 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  64.9 
 
 		 154 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  73.91 
 
 		 154 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  73.91 
 
 		 154 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  73.91 
 
 		 154 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  73.91 
 
 		 154 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  73.91 
 
 		 154 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  73.91 
 
 		 154 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  73.91 
 
 		 154 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  73.95 
 
 		 149 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  74.56 
 
 		 152 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  72.81 
 
 		 154 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  72.81 
 
 		 151 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  53.49 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  79.46 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  65.47 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  60.77 
 
 		 129 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  59.54 
 
 		 130 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  53.7 
 
 		 121 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  50.48 
 
 		 117 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  49.07 
 
 		 115 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  48 
 
 		 158 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  44.76 
 
 		 119 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  42.59 
 
 		 114 aa  99  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  44.76 
 
 		 115 aa  98.6  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  40.57 
 
 		 118 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  40.57 
 
 		 118 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  38.52 
 
 		 123 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  41.67 
 
 		 116 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  43.01 
 
 		 139 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  43.01 
 
 		 158 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  43.01 
 
 		 139 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  41.94 
 
 		 122 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  39.22 
 
 		 140 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  40.86 
 
 		 128 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  34.65 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  40.86 
 
 		 123 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  42.45 
 
 		 117 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  36.89 
 
 		 123 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  36.11 
 
 		 109 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  35 
 
 		 164 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  35.58 
 
 		 108 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  35.64 
 
 		 135 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  31.78 
 
 		 148 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  38.24 
 
 		 123 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  38.24 
 
 		 123 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  37.5 
 
 		 115 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  36.27 
 
 		 164 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  35.19 
 
 		 109 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  34.65 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  33.33 
 
 		 112 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  35.29 
 
 		 105 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  33.65 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  35.11 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  36.19 
 
 		 105 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  38 
 
 		 105 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  38.89 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  35 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  39 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  38.24 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  33.98 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  37 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  37.63 
 
 		 131 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  38 
 
 		 105 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  35 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  35.24 
 
 		 109 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  31.07 
 
 		 120 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  36.11 
 
 		 109 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  36.36 
 
 		 105 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  35.92 
 
 		 109 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  37.36 
 
 		 147 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  32.04 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>